弥罗宝阁系玄妙观的一大副殿，原坐落在三清殿后，九开间三层楼阁，殿宇上事玉皇、中事斗姥、下事地祗，神像庄严、图石精美、绚丽多姿。规模大于三清殿，结构独特，宏伟壮观。
正统三年（1438），巡抚周忱、知府况钟捐俸建弥罗宝阁，为玄妙观增添了一座气势宏伟，绚丽多姿的副殿。可惜在万历三十年（1602），宝阁已圮。

　　直到康熙十二年（1673），才由布政司慕天颜首倡重建，咸丰十年（1860）宝阁又毁。浙江红顶商人胡雪岩于光绪年间出巨资重建弥罗宝阁，这是近代史上，玄妙观首次出现的由外地富商单独捐资修庙的事例，可见玄妙观在当时的影响之大。惜宝阁于1912年八月毁于大火，满堂华彩付之一炬。